{"id":2778,"date":"2016-02-25T12:03:16","date_gmt":"2016-02-25T15:03:16","guid":{"rendered":"http:\/\/genomic.com.br\/portal\/?page_id=2778"},"modified":"2022-08-26T12:34:09","modified_gmt":"2022-08-26T15:34:09","slug":"sequenciamento-de-dna","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/sequenciamento-de-dna\/","title":{"rendered":"Sequenciamento de DNA"},"content":{"rendered":"\r\n<p>O sequenciamento de DNA \u00e9 um processo que determina a ordem dos nucleot\u00eddeos em uma amostra.<\/p>\r\n\r\n\r\n\r\n<p>A Genomic recebe:<\/p>\r\n\r\n\r\n\r\n<ul class=\"wp-block-list\">\r\n<li>Produtos de PCR purificados e dilu\u00eddos em \u00e1gua (na concentra\u00e7\u00e3o m\u00ednima de 20 ng em at\u00e9 5 ul de H2O). Para cada amostra enviada, a concentra\u00e7\u00e3o deve estar devidamente especificada e o cliente deve fornecer o(s) primer(s) de sequenciamento (na concentra\u00e7\u00e3o de 3.2 pmol em at\u00e9 2 \u03bcl de H2O) para cada rea\u00e7\u00e3o a ser realizada.<\/li>\r\n<li>Plasm\u00eddeo purificado e dilu\u00eddo em \u00e1gua (na concentra\u00e7\u00e3o m\u00ednima de 400ng em at\u00e9 5ul de H2O). Para cada amostra enviada, a concentra\u00e7\u00e3o deve estar devidamente especificada. O cliente deve fornece o(s) primer(s) de sequenciamento (na concentra\u00e7\u00e3o de 3.2 pmol em at\u00e9 2ul de H2O)\u00a0para cada rea\u00e7\u00e3o a ser realizada. A Genomic pode fornecer alguns primers universais para sequenciar DNA plasmidial.<\/li>\r\n<\/ul>\r\n\r\n\r\n\r\n<p>As amostras podem ser enviadas em tubos Eppendorf (at\u00e9 16 amostras) via Sedex \u00e0 temperatura ambiente. A partir de 17 amostras, receberemos apenas em placas para PCR de 96 po\u00e7os.<\/p>\r\n\r\n\r\n\r\n<p>Exce\u00e7\u00f5es:\u00a0<\/p>\r\n\r\n\r\n\r\n<ul class=\"wp-block-list\">\r\n<li>O cliente pode optar pelo servi\u00e7o de purifica\u00e7\u00e3o e quantifica\u00e7\u00e3o do DNA plasmidial, pagando uma taxa adicional.<br \/>\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0<\/li>\r\n<li>Caso a rea\u00e7\u00e3o de sequenciamento do cliente n\u00e3o funcione, enquanto que a do controle apresente um resultado satisfat\u00f3rio, esta rea\u00e7\u00e3o ser\u00e1 cobrada.<\/li>\r\n<\/ul>\r\n\r\n\r\n\r\n<p>Todas as amostras para a rea\u00e7\u00e3o de sequenciamento ser\u00e3o aceitas somente mediante a apresenta\u00e7\u00e3o das mesmas em foto de gel ap\u00f3s eletroforese. Esta foto deve incluir um marcador de peso molecular. Deve ser informado a quantidade das amostras aplicadas no gel (uL de amplicon\/plasm\u00eddeo por po\u00e7o).<\/p>\r\n\r\n\r\n\r\n<h3 class=\"wp-block-heading\"><strong>Exemplos de Eletroforese de Amplicons aceit\u00e1veis:<\/strong><\/h3>\r\n\r\n\r\n\r\n<figure class=\"wp-block-gallery columns-3 is-cropped wp-block-gallery-2 is-layout-flex wp-block-gallery-is-layout-flex\">\r\n<ul class=\"blocks-gallery-grid\">\r\n<li class=\"blocks-gallery-item\">\r\n<figure><img fetchpriority=\"high\" decoding=\"async\" width=\"546\" height=\"395\" class=\"wp-image-2789\" src=\"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Foto-Boa-3.jpg\" alt=\"Foto Boa 3\" data-id=\"2789\" data-full-url=\"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Foto-Boa-3.jpg\" data-link=\"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/foto-boa-3\/\" srcset=\"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Foto-Boa-3.jpg 546w, 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class=\"blocks-gallery-item\">\r\n<figure><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"532\" height=\"533\" class=\"wp-image-2783\" src=\"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Foto-Ruim-3.jpg\" alt=\"Foto Ruim 3\" data-id=\"2783\" data-full-url=\"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Foto-Ruim-3.jpg\" data-link=\"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/foto-ruim-3\/\" srcset=\"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Foto-Ruim-3.jpg 532w, https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Foto-Ruim-3-150x150.jpg 150w, https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Foto-Ruim-3-300x300.jpg 300w, https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Foto-Ruim-3-146x146.jpg 146w, https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Foto-Ruim-3-50x50.jpg 50w, https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Foto-Ruim-3-80x80.jpg 80w, 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Ap\u00f3s a confirma\u00e7\u00e3o de todos os dados, ser\u00e1 contado o prazo para a entrega dos resultados.\u00a0<\/p>\r\n\r\n\r\n\r\n<p><strong>Para o envio de amostras para o servi\u00e7o de sequenciamento, o cliente deve enviar uma planilha de excel (<a href=\"https:\/\/www.genomic.com.br\/portal\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/Descricao-de-amostras-para-sequenciar-pela-GEM.xls\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">clique aqui para baixar<\/a>) contendo as seguintes informa\u00e7\u00f5es:<\/strong><\/p>\r\n\r\n\r\n\r\n<figure class=\"wp-block-image\"><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/genomic.com.br\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/figura-sequenciamento.jpg\" alt=\"\" \/><\/figure>\r\n\r\n\r\n\r\n<p>As rea\u00e7\u00f5es de sequenciamento s\u00e3o realizadas usando o BigDye\u00ae Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit da fabricante Thermo Fisher Scientific ou o\u00a0BrightDye\u00ae Terminator Cycle Sequencing Kit da fabricante MCLAB (Molecular Cloning Laboratories). Os produtos de sequenciamento s\u00e3o submetidos \u00e0 eletroforese em um sequenciador modelo 3130xl ou 3500 da Applied Biosystems. S\u00e3o processados lotes que incluem um controle de DNA plasmidial (pGEM, fornecido pela Genomic). Normalmente, nossas rea\u00e7\u00f5es de sequenciamento alcan\u00e7am 650 bases, com uma fidelidade de an\u00e1lise de 99%.<\/p>\r\n\r\n\r\n\r\n<p>Os resultados s\u00e3o enviados por email. O cliente recebe um cromatograma (arquivo *.abi) sem edi\u00e7\u00e3o e um arquivo texto da sequ\u00eancia editada para cada rea\u00e7\u00e3o de sequenciamento. Consulte o prazo de entrega (11) 3288-1188.<\/p>\r\n\r\n\r\n\r\n<figure class=\"wp-block-image\"><img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/genomic.com.br\/wp-content\/uploads\/2016\/02\/no_noise.gif\" alt=\"\" \/><\/figure>\r\n\r\n\r\n\r\n<p>Para a leitura do arquivo *.ab1 ser\u00e1 necess\u00e1rio o uso de softwares apropriados.<\/p>\r\n\r\n\r\n\r\n<p>Estes softwares podem ser obtidos nas URLs:<br \/><a href=\"http:\/\/www.mbio.ncsu.edu\/BioEdit\/BioEdit.html\" class=\"broken_link\">http:\/\/www.mbio.ncsu.edu\/BioEdit\/BioEdit.html<\/a><br \/><a href=\"http:\/\/www.technelysium.com.au\/chromas.html\">http:\/\/www.technelysium.com.au\/chromas.html<\/a><br \/><a href=\"http:\/\/bat.infspire.org\/genomepd\/glass\/\">http:\/\/bat.infspire.org\/genomepd\/glass\/<\/a><br \/><a href=\"https:\/\/code.google.com\/archive\/p\/seqtrace\/\">https:\/\/code.google.com\/archive\/p\/seqtrace\/<\/a><br \/><a href=\"http:\/\/nucleobytes.com\/4peaks\/\">http:\/\/nucleobytes.com\/4peaks\/<\/a><\/p>\r\n\r\n\r\n\r\n<p><br \/><br \/>Os arquivos dos cromatogramas s\u00e3o guardados permanentemente na Genomic. As amostras enviadas s\u00e3o descartadas 15 dias ap\u00f3s o envio dos resultados e o cliente tem o mesmo per\u00edodo para questionar e\/ou reclamar.<\/p>\r\n\r\n\r\n\r\n<p><br \/><strong>Custos:<\/strong><br \/><strong>R$ 35,00<\/strong>\u00a0por rea\u00e7\u00e3o. Se uma amostra fornecida precisar de sequenciamento nas suas duas fitas, ser\u00e1 necess\u00e1rio realizar\u00a0<strong>duas<\/strong>\u00a0rea\u00e7\u00f5es de sequenciamento.<\/p>\r\n\r\n\r\n\r\n<p>Rea\u00e7\u00f5es de sequenciamento prontas para injetar devem ser enviadas refrigeradas e t\u00eam um custo de\u00a0<strong>R$\u00a011,00<\/strong>\u00a0por rea\u00e7\u00e3o. O pre\u00e7o de cada purifica\u00e7\u00e3o e quantifica\u00e7\u00e3o \u00e9 de<strong>\u00a0R$ 14,00<\/strong>.<\/p>\r\n\r\n\r\n\r\n<p>A Genomic introduziu na sua rotina um screening aleat\u00f3rio de quantifica\u00e7\u00e3o das amostras recebidas, uma vez que tem sido observado um descompasso significativo entre o valor indicado e o valor real da concentra\u00e7\u00e3o. Caso a amostra n\u00e3o tenha a massa suficiente para realiza\u00e7\u00e3o do sequenciamento, ser\u00e1 cobrada uma taxa de R$ 6,50 pela quantifica\u00e7\u00e3o, e a rea\u00e7\u00e3o de sequenciamento n\u00e3o ser\u00e1 realizada. Nesse momento o solicitante ser\u00e1 contatado.<\/p>\r\n\r\n\r\n\r\n<p>Consulte descontos para grandes quantidades.<\/p>\r\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>O sequenciamento de DNA \u00e9 um processo que determina a ordem dos nucleot\u00eddeos em uma amostra. A Genomic recebe: Produtos de PCR purificados e dilu\u00eddos em \u00e1gua (na concentra\u00e7\u00e3o m\u00ednima de 20 ng em at\u00e9 5 ul de H2O). Para cada amostra enviada, a concentra\u00e7\u00e3o deve estar devidamente especificada e o cliente deve fornecer o(s) &#8230; <a title=\"Sequenciamento de DNA\" class=\"read-more\" href=\"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/sequenciamento-de-dna\/\" aria-label=\"More on Sequenciamento de DNA\">Ler mais<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-2778","page","type-page","status-publish"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2778","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2778"}],"version-history":[{"count":4,"href":"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2778\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":4591,"href":"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2778\/revisions\/4591"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/genomic.com.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2778"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}